教育部科学技术研究重点项目(104232)
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 相关作者：夏永静刘湘军蒋博刘青焱张颜更多>>
- 相关机构：清华大学北京林业大学更多>>
- 发文基金：教育部跨世纪优秀人才培养计划教育部科学技术研究重点项目清华-裕元医学科学研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 一种文本数据挖掘与可视化的新方法被引量：2
- 2008年
- 传统搜索引擎的搜索结果采用的是以一维列表的形式展现,随着文献数据的急剧增多,用户对于搜索结果的辨识和分析速度也在急剧下降。为了弥补传统工具的这一不足,本文开发了"语义图"(semantic map,SMAP),此工具对文献数据进行数据挖掘和可视化,包括关联匹配和聚类,将搜索结果以二维矩阵图的形式展示出来,方便用户理解数据之间的内部联系,并帮助用户迅速从整体上把握搜索结果。最后以蛋白质组学文献分析过程为例具体展示了此工具的应用。
- 宋驰刘青焱张颜蒋博徐振愚夏永静刘湘军
- 关键词：可视化语义图
- 在全基因组范围内筛选酵母中砷抗性相关基因被引量：2
- 2007年
- 砷化物是广泛应用的抗癌药物,特别是对白血病有显著疗效.然而,治疗过程中病人会因对砷化物具有耐药性而影响治疗效果,而目前对于砷抗性机制尚缺全面深入的研究.利用酵母作为模式生物,使用不同浓度的砷对由4757个酵母缺失型突变体组成的菌株库进行筛查.共鉴定出104个基因/开放阅读框(ORF),其缺失导致酵母对砷的抗性增加.生物信息学分析结果提示,这些基因与mRNA分解代谢、应激反应、组蛋白乙酰化和蛋白质合成及分解代谢等功能有关.同时这些基因中多于半数具有哺乳动物同源类似物.所以,进一步研究这些基因有望为人类砷化物的耐药性及毒性机制研究提供富有价值的新线索.
- 杜丽张新宇虞甬陈静思刘艳夏永静刘湘军
- 关键词：砷化物酵母表型抗性
