景炅婕 作品数:32 被引量:92 H指数:6 供职机构: 山西农业大学动物科技学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山西省国际科技合作计划 山西省科技攻关计划项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 文化科学 更多>>
用于神经肽受体筛选的方法 本发明公开了一种用于神经肽受体筛选的方法,依据统计学原理,要求基因组测序结果FDR校正后的P<0.05,基因差异表达倍数的选择依据是配体‑受体结合产生的效应强度与占领受体的数量成正比;采用蛋白同源建模技术建立蛋白模型;综... 李鹏飞 吕丽华 谢建山 孟金柱 刘岩 姚晓磊 赵妙妙 景炅婕 毕锡麟 王锴文献传递 绵羊不同部位脂肪组织microRNA高通量测序及生物信息学分析 被引量:8 2016年 本研究旨在挖掘绵羊不同脂肪组织中特异表达的miRNAs。构建肾周(PEF)、皮下(SUF)和尾部(TAF)脂肪组织的3个小RNA文库,利用Solexa测序技术进行测序,用Stem-loop qRT-PCR技术和生物信息学方法对测序结果进行验证和分析。结果表明,8个随机选择的miRNAs中有7个miRNAs的表达与测序结果一致。在肾周和皮下脂肪组织的sRNA文库中分别检测到128和112个保守miRNAs,分别发现198和196个新miRNAs。结合前期在尾脂中检测到miRNAs的分析结果,肾周脂肪中特异表达的有12个保守的和66个新miRNAs;皮下脂肪中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和30个;尾脂中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和34个。上述结果将为进一步研究miRNA调控绵羊的脂肪代谢提供科学依据。 张方 胡子乔 景炅婕 潘洋洋 乔利英 李宝钧 刘建华 刘文忠关键词:绵羊 脂肪组织 MICRORNA 生物信息学方法 钴的动物营养学功能 被引量:3 2012年 钴作为动物体内一种必需的微量元素,虽然动物对其需要量并不大,但钴对动物的造血机能、免疫机能、生长发育及繁殖,特别是对反刍动物瘤胃微生物合成VB12等起着重要的作用,钴与其他微量元素合用会有更加明显的效果。钴缺乏会引起动物生产性能的下降,易给畜牧业带来很大经济损失,因此,随着科学研究的深入,钴的重要营养作用也逐渐被发现并受到人们的重视。就钴的生物学作用、钴的营养学作用机制、钴缺乏的发病机制、与其他营养素之间的关系及其在动物营养中的重要作用进行了阐述。 景炅婕 原慧 马淑洁 王欣雨关键词:钴 营养作用 绵羊Lpin2基因多态性及其与尾型和屠宰性状的关联分析 被引量:4 2017年 试验旨在研究Lpin2基因遗传变异对绵羊尾型和屠宰性状的影响。以两品种脂尾型绵羊广灵大尾羊和小尾寒羊为研究对象,采用DNA直接测序法检测Lpin2基因5′非编码区部分序列的单核苷酸多态性(SNPs),并分析其与尾型及屠宰性状的关联性。结果发现,Lpin2基因5′非编码区起始密码子上游约1 200bp的DNA序列中存在3个SNPs,即NC_019480.2:g.-663dup ATT(SNP1)、g.-388T>C(SNP2)和g.-330T>G(SNP3),其中SNP1为三核苷酸ATT重复扩展短串联重复序列(STR)的拷贝数变异(CNV),在广灵大尾羊中的突变频率显著高于小尾寒羊(P<0.05),显著降低了广灵大尾羊的胴体重与屠宰率(P<0.05),对小尾寒羊的屠宰性状无显著影响(P>0.05)。SNP2和SNP3构成单倍型块,形成的单倍型对各性状无显著影响(P>0.05)。试验结果可为绵羊肉质性状的标记辅助选择提供参考依据。 焦小丽 景炅婕 乔利英 洪中山 李留安 田川尧 康翠翠 陈明明 刘文忠关键词:绵羊 单核苷酸多态性 绵羊Wnt2蛋白生物信息学分析 被引量:6 2019年 Wnt2蛋白是Wnts蛋白家族的重要成员,参与卵巢的发育。本研究以NCBI蛋白质数据库中发布的Wnt2蛋白氨基酸序列为研究对象,采用生物信息学软件对Wnt2蛋白的理化性质、信号肽及跨膜结构域、糖基化和磷酸化位点、二级结构和功能结构域、亚细胞定位和功能结构分类、序列相似比对及聚类、三级结构进行预测分析。结果发现,绵羊Wnt2由360个氨基酸组成,其等电点为9.21,有糖基化位点和磷酸化位点,是一个有信号肽的稳定的蛋白;二级结构与三级结构一致,均显示Wnt2由α-螺旋、延伸链、无规则卷曲构成;绵羊Wnt2蛋白是细胞外蛋白,主要参与信号转导和转录调控。研究结果为深入探讨Wnt2基因及其编码蛋白的结构和功能提供相关依据。 薛丽娜 薛丽娜 景炅婕 党文庆 李鹏飞关键词:绵羊 生物信息学 蛋白质结构 基于Illumina平台转录组测序筛选牛卵泡发育调控基因 被引量:4 2019年 运用超声波监测技术,采集母牛发情期出现偏差前的第一大卵泡PDF1和出现偏差后的第二大卵泡ODF2,分别分离卵泡颗粒细胞(GCs),构建RNA文库,用Illumina2000测序;测序结果经数据库搜索和差异表达筛选,采用DAVID软件GO和KEGG pathway分析,经Genecards功能查询,筛选牛卵泡发育相关基因。结果表明:数据库搜索共获得35 325个基因,其中有意义的表达基因15 645个,从中筛选获得差异表达基因608个;GO分析表明,608个差异表达基因中参与生物过程的基因占60.46%,细胞组分的基因占20.08%,分子功能的基因占11.46%;KEGG pathway分析表明,608个差异表达基因通过9条信号通路参与牛卵泡发育调控(P<0.05),经Genecards功能筛选,共获得11个与牛卵泡发育密切相关的调控基因——SESN3、COL3A1、CCNE1、CAV1、CACNA1H、ITPR1、PIK3R3、MYC、PTGFR、CDK6、GAPDH,它们直接参与细胞增殖分化及信号通路调节。 郝庆玲 景炅婕 朱芷葳 吕丽华 李鹏飞关键词:卵泡 颗粒细胞 转录组 调控基因 外源注射CART特异性dsRNA对蛋鸡产蛋性能和蛋品质的影响 2016年 选择500只健康、20周龄的海兰褐蛋鸡,预饲30 d后随机平均分为5组,每组4个重复,分别进行如下处理:生理盐水仅第1天注射一次组(A组,对照组)、可卡因—苯丙胺调节转录肽(CART)特异性双链RNA(dsRNA)仅第1天注射一次组(B组)、CART dsRNA每40 d注射一次组(C组)、CART dsRNA每20 d注射一次组(D组)、CART dsRNA每10 d注射一次组(E组),120 d后对各处理组蛋鸡的产蛋性能、蛋品质、蛋组分和体重变化进行测定,研究CART对产蛋期蛋鸡的产蛋性能和蛋品质的影响.结果表明:各试验组之间以及与对照组之间在产蛋率上均存在差异(P<0.05);B组的日产蛋量与对照组的差异不显著,其他试验组与对照组的差异显著(P<0.05);各试验组的采食量均高于对照组(P<0.05);从蛋料比来看,B、C组与对照组的差异不显著,D组与E组的差异不显著,但均与对照组存在差异(P<0.05);各试验组蛋品质、蛋组分与对照组的差异不显著;试验结束后,各试验组蛋鸡的体重变化与对照组均存在差异(P<0.05).总之,CART dsRNA对海兰褐蛋鸡产蛋性能和体重变化的影响显著,对蛋品质和蛋组分的影响不显著. 李鹏飞 景炅婕 毕锡麟 王锴 张子宁 吕丽华关键词:蛋鸡 产蛋性能 蛋品质 SIRT1基因在绵羊不同组织器官中的差异性表达研究 被引量:3 2015年 SIRT1(silent mating type information regulation 2homolog1)是一种具有NAD+依赖性去乙酰化酶活性的转录调节因子,参与能量代谢的调节。利用实时荧光定量PCR技术,对10月龄山西肉用绵羊母本品系去势公羊内脏(肝、肾、脾、肺、心)、肌肉(背最长肌)和脂肪(大网膜、小网膜、肠系膜、腹膜后、皮下)等11种器官或组织中SIRT1基因mRNA的表达量进行检测,以探讨SIRT1基因的差异性表达规律。结果表明,绵羊SIRT1基因在所检测的器官或组织中均有表达,且差异极显著(P<0.001)。主要表现在脾脏、肝脏和肾脏中的表达显著高于心脏和肺脏中的表达;深层脂肪组织中的表达高于浅层的皮下脂肪;在背最长肌中也有较高表达。这些差异与绵羊SIRT1基因调节脂质代谢及糖异生有关。有关结果为研究SIRT1基因的功能奠定了科学依据。 潘洋洋 景炅婕 乔利英 贾夏丽 张静 张方 胡子乔 刘文忠关键词:绵羊 SIRT1 实时定量PCR 组织器官 绵羊及相关物种去乙酰化酶1的理化性质和蛋白结构预测 被引量:2 2015年 为深入研究SIRT1基因及其编码蛋白的结构和功能,特别是在各信号通路中的作用,本文基于NCBI发布的包括绵羊在内的9个物种的SIRT1基因的核苷酸和蛋白质序列,采用生物信息学方法分析SIRT1蛋白的理化性质和蛋白结构,预测了绵羊SIRT1蛋白的结构和翻译后修饰位点。结果表明,不同物种SIRT1蛋白的理化性质基本一致。绵羊SIRT1是一种接近于中性的亲水性脂溶蛋白,预测其有40个潜在的O-糖基化位点、2个N-糖基化位点、33个磷酸化位点、18个乙酰化修饰位点、11个泛素化修饰位点和3个类泛素化修饰位点。这些结果为进一步研究SIRT1的功能和表达调控奠定了科学依据。 景炅婕 张静 贾夏丽 梁琛 刘建华 潘洋洋 张方 胡子乔 任端阳 刘文忠关键词:绵羊 生物信息学分析 蛋白结构 牛卵泡TEDDM1表达特点及其功能分析 被引量:4 2019年 旨在研究牛卵泡跨膜附睾蛋白1(transmembrane epididymal protein 1,TEDDM1)的分子特征和立体结构,并结合TEDDM1在不同生理状态牛卵泡的表达特性分析其功能。本研究采集牛发情期第一卵泡波优势卵泡(dominant follicle,DF)和从属卵泡(subordinate follicle,SF),分别分离颗粒细胞(granulosa cells,GCs),提取总RNA后反转录,设计牛 TEDDM 1特异性引物进行PCR扩增、克隆、测序,获得全CDS区后运用生物信息学方法对序列结构进行分析;以牛 RPLP 0作为内参基因,在DF和SF中使用qRT-PCR对 TEDDM 1的表达量进行检测;兔抗TEDDM1一抗检测TEDDM1在牛卵泡中的表达和定位。结果表明, TEDDM 1基因CDS区全长903 bp,编码300个氨基酸,有7次跨膜的α螺旋结构,属于典型的G蛋白偶联受体,该基因氨基酸序列与非洲野牛( Bison bison bison )序列相似性最高,为99.4%;功能域分析表明,TEDDM1分子中存在未知功能结构域,蛋白家族716(domains of unknown function protein families 716,DUF716)结构域。qRT-PCR分析表明, TEDDM 1 mRNA在SF的表达量显著高于DF( P <0.05);免疫组化分析表明,TEDDM1在DF和SF的颗粒层和膜层细胞均有表达,特异性显色强度表明TEDDM1在SF颗粒层和膜层细胞表达量均高于DF。本研究为进一步探讨TEDDM1在牛卵泡发育过程中的调控作用及其在信号转导和激素调节中的功能提供了依据,为后期深入研究牛卵泡发育机理奠定基础。 朱芷葳 郝庆玲 侯淑宁 景炅婕 赵成萍 吕丽华 李鹏飞关键词:卵泡 G蛋白偶联受体