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周代占

作品数：4 被引量：7H指数：2
供职机构：上海交通大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇医药卫生
  • 1篇生物学

主题

  • 2篇基因
  • 2篇甲基化
  • 2篇DNA甲基化
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇遗传学
  • 1篇中国汉族
  • 1篇中国汉族人
  • 1篇中国汉族人群
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇受体
  • 1篇受体基因
  • 1篇数据库
  • 1篇糖尿
  • 1篇糖尿病
  • 1篇肿瘤
  • 1篇晚期
  • 1篇晚期非小细胞

机构

  • 3篇上海交通大学
  • 2篇中国科学院上...
  • 1篇复旦大学
  • 1篇上海市胸科医...
  • 1篇上海健康医学...

作者

  • 4篇周代占
  • 2篇贺林
  • 1篇万春玲
  • 1篇廖美琳
  • 1篇贺林
  • 1篇陈智伟
  • 1篇刘赟
  • 1篇李子明
  • 1篇牛晓敏
  • 1篇陆舜
  • 1篇沈盛萍
  • 1篇胡晓雯
  • 1篇张娟
  • 1篇杨超

传媒

  • 1篇中华消化杂志
  • 1篇中国肺癌杂志
  • 1篇中国科学：生...

年份

  • 1篇2021
  • 1篇2017
  • 1篇2011
  • 1篇2009
共 4 条 记 录，以下是 1-4
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排序方式：
尼古丁乙酰胆碱受体基因CHRNA3的多态性和中国汉族人群肺癌风险关系的研究及其在晚期非小细胞肺癌中的预后分析
2009年
目的：研究编码尼古丁乙酰胆碱受体（nicotinic acetylcholine receptors，nAChRs）的候选基因CHRNA3的多态性与中国汉族人群肺癌风险的关系，进一步探讨其对晚期非小细胞肺癌（non-small cell lung cance，NSCLC）患者预后的影响。方法：对就诊于上海交通大学附属上海市胸科医院的547例肺癌患者，和上海市浦东新区和宝山区的567例健康人群进行病例．对照研究。选取候选基因CHRNA3上的3个SNPs位点（rs3743073．rs3743076和rs3743078），运用Taqman荧光定量基因分型技术，对该1114例中国汉族人进行基因型分析。采用非条件logistic回归分析法，比较各基因型在病例组与对照组中分布频率的差异，探讨其与肺癌的关系。进一步在101例不可手术ⅢB期／Ⅳ期NSCLC患者中探讨基因CHRNA3的多态性变化与预后的关系。
牛晓敏廖美琳李子明刘赟陈智伟郑莹周代占沈盛萍吴春晓陆舜贺林
关键词：肺癌病例对照研究
一种基于多重PCR的人类线粒体基因组高通量测序方法被引量：5
2017年
人类线粒体基因组DNA(mtDNA)是一个16569 bp的双链闭合环状DNA分子,具有母系遗传、多拷贝、高异质性及高变异率等特点,是研究人类遗传和进化上广泛使用的分子标记.近几年,高通量测序技术的出现,使得在短时间内准确测定mtDNA序列成为可能;但目前常用的高通量测序建库方法操作复杂、研究费用相对较高.基于多重PCR扩增的测序方法具有高效率、高灵敏度、低成本的特点,因而适用于大规模线粒体基因组的变异检测分析.利用73个相互重叠的扩增子通过多重PCR方法来扩增中国人的线粒体全基因组,在扩增片段两端连接特定的接头序列,然后在IlluminaHiSeq X Ten平台上进行高通量测序.对获得的测序数据分析发现,mtDNA每个位点的测序深度均达到2000×以上;当测序深度为100×时,所有样本的序列覆盖度都达到100%;数据质量适用于后续的变异检测分析.利用本研究建立的基于多重PCR的二代测序方法无需片段化即可直接上机测序,在复杂遗传病的研究中有着广泛的应用前景.
孙嘉仪杨超胡晓雯张娟周代占贺林万春玲
关键词：多重PCR
二型糖尿病及代谢相关指标的遗传学和表观遗传学研究
近年来，随着生活方式的不断改变，2型糖尿病及其它慢性代谢疾病的发病率在我国逐年上升，正一步步加大我国的公共卫生和医疗的负担，成为一个很严重的的社会问题。由此，针对于我国慢性代谢疾病的危险因素、发病机制、疾病的预防与治疗的...
周代占
关键词：二型糖尿病遗传学DNA甲基化
基于数据库挖掘分析微RNA-129-1在结肠癌中的表达和意义被引量：2
2021年
目的探讨微RNA(miRNA)-129-1在结肠癌中的表达、调控、潜在作用机制和临床意义。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中结肠癌的甲基化、mRNA表达和miRNA表达数据,分析miRNA-129-1表达和甲基化的变化。利用miRwalk 2.0和TargetScan数据库联合预测miRNA-129-1靶基因,采用DAVID 6.7在线软件对靶基因进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,并再次利用TCGA数据库对miRNA-129-1的关键靶基因进行表达差异分析和预后分析。统计学方法采用配对t检验、独立样本t检验,通过受试者操作特征曲线(ROC)评估miRNA-129-1甲基化对结肠癌的诊断价值,采用Kaplan-Meier法和log-rank检验分析miRNA-129-1表达对患者生存的影响。结果miRNA-129-1在各物种之间序列保守。对TCGA数据库所有结肠癌肿瘤样本和对照样本进行分析,结果显示肿瘤样本中miRNA-129-1的表达与对照样本比较降低(0.98±0.81比5.74±0.59),cg04524088、cg04840800、cg11364290、cg20734982、cg24044186位点的甲基化水平与对照样本比较均降低(0.321±0.130比0.563±0.051、0.432±0.123比0.624±0.064、0.475±0.153比0.768±0.033、0.659±0.180比0.816±0.037、0.862±0.096比0.916±0.019),差异均有统计学意义(t=14.95、11.36、9.39、11.74、5.32、3.47,P均<0.01)。ROC分析结果显示,miRNA-129-1上述5个位点的甲基化水平对结肠癌有较高的诊断效能[曲线下面积分别为0.946、0.915、0.950、0.758、0.667,P均<0.01]。生存分析结果显示,miRNA-129-1低表达与不良预后有关(风险比为0.55,P=0.018)。生物信息学分析发现miRNA-129-1的靶基因显著富集于丝氨酸/苏氨酸激酶受体、丝裂原活化蛋白激酶等与肿瘤密切相关的功能基因簇,其靶基因编码蛋白质之间存在复杂的相互作用网络。miRNA-129-1的潜在关键靶基因肝配蛋白B型受体2(EPHB2)基因高表达与总生存期和无病生存期短
王善娟周代占张丽航徐鹏朱健伟张燕华
关键词：结肠肿瘤DNA甲基化生物信息学分析
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