目的描述一株新鉴定的流行重组型HIV-1 CRF103_01B在北京的检出情况,并分析其近全长基因组(near full-length genome,NFLG)遗传特征。方法对2017—2020年北京新诊断或初始抗病毒治疗病例进行HIV-1基因型耐药监测,发现5例疑似感染CRF103_01B毒株。通过逆转录、近末端稀释法,分两段巢式PCR扩增HIV-1 NFLG。获得的序列与分型参考序列进行基因比对,使用MEGA11软件构建邻接法(neighbor-joining,NJ)系统进化树。用SimPlot 3.5软件分析确定基因重组断点,绘制基因组结构图。基于亲本毒株同源NFLG序列比对,挑选较长的重组片段构建NJ进化树,判断可能的亲本毒株来源。用斯坦福大学HIV耐药数据库解析基因型耐药特征。结果共获得5条CRF103_01B NFLG序列,其中4例经男男性行为(men who have sex with men,MSM)感染,1例为女性。与从河北检出的4条CRF103_01B NFLG序列合并分析其重组特征:在CRF01_AE骨架上,gag、pol和nef-3'-LTR基因片段被B亚型重组替换[HXB2 nt 1111±19-1539±16,2531-4478±16(片段Ⅴ),9008±23-9615]。亲本来源分析显示,CRF103_01B的片段Ⅳ与Ⅴ分别与北京B亚型(BJMP3294B)和g5簇CRF01_AE序列(JX112804)聚集成大单系进化簇(bootstrap值分别为97%和100%)。9个CRF103_01B病例均携带非核苷类逆转录酶抑制剂类V106I突变。结论CRF103_01B毒株最可能起源于北京MSM人群,并在北京和河北等地的MSM人群中低水平持续流行,并经异性性途径向一般人群播散。需加强该毒株分子流行病学和耐药监测,关注疾病进展。
目的探究北京市MSM(men who have sex with men)人群中流行的HIV-1 CRF01_AE的耐药情况和基因进化特征。方法对2020—2022年在北京市艾滋病咨询检测门诊进行HIV初筛有反应的MSM人群进行HIV抗体免疫印迹检测和pol基因扩增检测。依据pol基因经COMET HIV-1进行分型,把分型为CRF01_AE的序列提交斯坦福HIV耐药数据库进行耐药分析,并用BEAST 1.10.4开展CRF01_AE基因进化特征研究。结果共招募到322例HIV初筛检测有反应人员,其中有243例(75.5%)感染者pol基因扩增检测阳性,对其进行Sanger法测序,剔除12条测序结果不佳的序列后,共获得231条序列,共有15种基因亚型,其中CRF01_AE(34.2%,79/231)和CRF07_BC(42.4%,98/231)是最主要亚型。CRF01_AE的传播性耐药发生率为6.3%,以PIs类药物最为常见(3.8%,3/79)。系统进化分析显示,北京地区MSM人群主要流行CRF01_AE的第四簇和第五簇,CRF01_AE的种群进化速率为2.09×10^(-3)(95%HPD,1.67~2.54),CRF01_AE种群规模持续增长。结论2020至2022年CRF01_AE亚型是北京地区MSM人群HIV感染的主要亚型之一。CRF01_AE传播性耐药率较高,应加强对传播性耐药的监测和防控。CRF01_AE种群规模较大,应关注CRF01_AE种群流行趋势,采取有效防控措施。
