吴芸
- 作品数：39 被引量：91H指数：6
- 供职机构：遵义师范学院更多>>
- 发文基金：博士科研启动基金贵州省教育厅自然科学研究项目贵州省科学技术基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学医药卫生更多>>
- 务川黑牛mtDNA遗传变异及起源进化分析被引量：1
- 2012年
- 目的:测定务川黑牛mtDNA D-loop区全序列,以了解其遗传背景。方法:采用PCR直接测序方法测定务川黑牛mtD-NA D-loop区全序列。结果:32个个体D-loop区的全序列中,四种碱基A、T、C和G含量分别为:33.1%、28.4%、25.0%和13.5%,A+T平均含量61.5%。经过序列比对,共检测到57个变异位点,占所测mtDNA序列总长的6.26%,其中转换54个,颠换3个;产生17种单倍型,其中6种是普通牛单倍型,11种是瘤牛单倍型;平均核苷酸差异为22.623,单倍型多样度0.901±0.039,核苷酸多样度0.0249±0.00147。结论:务川黑牛这一品种遗传多样性非常丰富,据此构建的NJ进化树显示务川黑牛含有普通牛和瘤牛的血统。
- 蒋自立吴芸田雄马培江
- 关键词：线粒体DNAD-LOOP单倍型
- 贵州4个山羊群体mtDNACytb基因多态性研究被引量：5
- 2010年
- 为了从核酸水平上分析贵州4个山羊群体线粒体DNA细胞色素b基因（mtDNACytb）的遗传多样性及亲缘关系,对贵州白山羊、贵州黑山羊、贵州麻羊及贵州小香羊4个山羊群体,共计55个个体mtDNACytb基因片段进行测序分析和比较。结果表明：55条山羊的Cytb基因序列均为1140bp的同源基因序列;总共发现11个变异位点,观察到10种单倍型;4个山羊群体中单倍型多样性为0.442-0.889,核苷酸多样度为0.00145-0.0025。贵州山羊的遗传多样性处于中等水平;贵州山羊可分为两大类群,即贵州黑山羊和贵州麻羊2个群体为一类;贵州白山羊和贵州小香羊2个群体为另一类。
- 黄勤华刘若余吴芸王兴群
- 关键词：线粒体细胞色素B多态性贵州山羊
- 课程思政在地方师范院校生物化学教学中的探讨被引量：8
- 2021年
- 立德树人是高等师范院校开展教育的立身之本,一直以来,相对于对学生价值观的引领,师范院校更加重视对学生专业知识的传授和师范技能的指导。随着网络的普及,大学生获得知识的途径和内容不断增多,他们正是思维活跃、认知逐渐形成的时期,单一的课程教育方式已不能满足教书育人的目的,需要建立全方位立体育人体系。把思想政治元素融入到生物化学这门专业基础课教学活动中,探讨两者的自然有效融合,有助于大学生在收获专业知识的同时提升个人修养,塑造正确的人生观、世界观和价值观,培养学生师德师风和责任担当。
- 吴芸蒋自立闫吉美李春涛
- 务川黑牛SOCS基因家族表达调控分析被引量：2
- 2017年
- 本实验旨在研究务川黑牛SOCS基因家族的表达及调控,分别提取8头成年务川黑牛的背最长肌、腰大肌、肝脏、心脏、脾脏、小肠、肺、皮下脂肪共8个组织样品的RNA,应用实时荧光定量PCR技术检测务川黑牛SOCS基因家族在不同组织中m RNA的相对表达量。结果表明:务川黑牛SOCS基因家族成员m RNA在不同组织中均有表达,在脾脏和背最长肌中表达量较高,在腰大肌和心脏中表达量很低;CIS基因和SOCS2基因在多个组织中m RNA表达量较低且非常接近,CIS和SOCS2基因可能以低表达量形式协同参与生长调控;SOCS1和SOCS3在多个组织中m RNA表达量均较高且接近;SOCS4和SOCS5基因m RNA表达谱特征具有较高相似性,其功能发挥可能具有一定相关性。
- 王金洲蒋自立张强陈瑶杨永强盘道兴王振刘若余吴芸
- 关键词：SOCS荧光定量PCR
- 务川黑牛微卫星座位遗传多样性分析被引量：3
- 2012年
- 以贵州地方牛优良品种务川黑牛为研究对象,选取分布于其7条染色体上的ETH10、ILSTS033、CSSM66、BM2113、ETH225、BM1818和CSRM60共7对微卫星引物进行遗传多样性分析。结果共检测到21个等位基因,每个微卫星座位等位基因数为2～5个,7个微卫星座位均未达到Hardy-Weinberg平衡。7个位点的平均等位基因数、平均有效等位基因数、平均期望杂合度、平均多态信息含量分别为3.000 0±1.154 7、2.377 3±0.585 4、0.558 4±0.101 6、0.475 9±0.125 1,说明务川黑牛具有良好的遗传多样性。为务川黑牛种质资源保存和改良提供了试验基础。
- 吴芸蒋自立田雄马培江
- 关键词：微卫星
- 赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区遗传多样性和进化分析被引量：1
- 2024年
- 为探究赤水乌骨鸡线粒体DNA控制区的遗传多样性、单倍型特征和母系起源情况,利用PCR扩增和直接测序法检测了63只赤水乌骨鸡线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)控制区(D-loop)全序列,分析其遗传多样性和单倍型特性,并与不同红色原鸡亚种的序列进行聚类分析。结果表明,赤水乌骨鸡mtDNA D-loop区全序列共检测到29个突变位点,构成19种单倍型。遗传多样性分析表明,单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.990 5±0.018 0、0.006 5±0.000 5和7.981。系统发育分析显示,赤水乌骨鸡19种单倍型可划分为A、B、C、E、G 5个单倍型群,A、B均分别与原鸡滇南亚种聚类,单倍型群C与原鸡印度亚种、原鸡滇南亚种和原鸡海南亚种聚为一类,E单倍型群分支与印度亚种和原鸡滇南亚种聚为一类。据此推测,赤水乌骨鸡遗传多样性丰富,可能有多个母系起源,主要源于原鸡滇南亚种。
- 吴芸李盼盼闫吉美杨凤黄锡阳
- 关键词：MTDNA控制区系统进化
- 基于转录组测序筛选鸡蛋绿壳性状相关基因被引量：2
- 2023年
- 【背景】绿壳蛋深受消费者喜爱,蛋壳绿色的深浅在市场上是影响绿壳蛋定价销售的重要参考指标。绿壳蛋的形成受多基因共同调控,蛋壳绿色深浅不一,其分子机理尚不清楚。通过对赤水乌骨鸡蛋壳腺组织进行转录组测序,挖掘其调控绿壳蛋蛋壳颜色深浅的候选基因以及关键信号通路,探究影响蛋壳颜色遗传性,以期发展绿壳蛋的选种选育和提高经济效益。【目的】探讨赤水乌骨鸡的遗传基础,并通过SLCO1B3基因分型对其进行鉴定和筛选,以期通过分子标记在青壳鸡育种规划中提供新的见解,并在后期的选择策略中帮助控制和提高赤水乌骨鸡蛋壳品质的同质性。【方法】以纯系的280日龄赤水乌骨鸡为研究对象,屠宰产浅绿色蛋(QL)和深绿色蛋(SL)的母鸡各3只,采集蛋壳腺以RNA-seq技术检测分析,筛选与蛋壳颜色密切相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对这些DEGs进行GO和KEGG富集分析。利用qRT-PCR技术检测与蛋壳颜色相关的6个候选基因的转录水平变化以验证转录组数据可靠性。【结果】在深绿组与浅绿组中共筛选到93个显著DEGs,有59个基因在深绿组中显著上调,34个显著下调。DEGs注释到GO数据库进行比对,主要显著性富集的是钠离子转运、负离子结合、肌质网膜等。KEGG分析富集程度最显著的是醛固酮调节钠的重吸收,以及富集的矿物质吸收、亚油酸的新陈代谢等信号通路。通过qRT-PCR验证,结果显示这些基因的表达趋势与转录组的测序结果一致。【结论】经功能分析,TF基因、SCNN1家族基因、CYP450家族基因、SLC家族基因和FAM家族基因,以及醛固酮调节钠的重吸收信号通路参与蛋壳色素合成、转运和沉积。上述基因和信号通路可能是影响赤水乌骨鸡蛋壳绿色深浅不一的候选基因和关键信号通路。
- 肖涛李辉罗韦叶涛余欢陈友波石钰仕赵德鹏吴芸
- 关键词：转录组测序绿壳蛋蛋壳颜色QRT-PCR
- 无量山乌骨鸡肝脏组织发育特征及脂蛋白脂酶基因表达研究
- 2024年
- 【目的】明确无量山乌骨鸡肝脏组织发育过程中脂质沉积和脂酶活性的变化特征以及与脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)基因表达的相关性。【方法】以1(D1)、42(D42)、84(D84)、126(D126)日龄共4个阶段的无量山公鸡和母鸡为研究对象,测定体重和肝脏组织重量并计算肝脏指数,HE石蜡切片染色鉴定肝脏组织的形态学变化,采用甘油三酯(triglyceride,TG)检测试剂盒(单试剂GPO-PAP法)检测肝脏组织中TG含量,采用比色法检测LPL和肝酯酶(hepaticlipase,HL)活性,采用实时荧光定量PCR检测肝脏组织中LPL基因mRNA表达量,采用Pearson相关性分析确定LPL基因表达量和肝脏组织各指标之间的相关性。【结果】无量山乌骨鸡公鸡和母鸡在不同生长阶段肝脏重差异均显著(P<0.05),D42和D84肝脏指数分别与D1和D126相比差异显著(P<0.05);公鸡和母鸡肝脏组织中TG含量均在D84时出现峰值;母鸡LPL和HL活性在D126时达到顶峰且显著高于其他阶段(P<0.05),公鸡LPL和HL活性在D42时达到顶峰,公母鸡总脂酶活性分别在D42和D126时达到顶峰且显著高于其他阶段(P<0.05);公鸡和母鸡肝脏组织LPL基因mRNA表达的峰值分别在D42和D1,且母鸡LPL基因mRNA表达量在D1、D42和D126共3个发育阶段均与HL活性呈显著相关(P<0.05)。【结论】无量山乌骨鸡肝脏组织重量、肝脏指数、TG含量、脂酶含量和LPL基因mRNA表达量在不同发育阶段变化较大,而成鸡脂酶活性主要受性别影响,母鸡中LPL基因mRNA表达量与HL活性显著相关。结果为进一步研究无量山乌骨鸡肝脏脂肪代谢调控机制提供科学依据。
- 施艳燕陈建忠吴培福吴芸陈粉粉
- 关键词：肝脏脂蛋白脂酶
- 赤水乌骨鸡PITX1基因克隆、生物信息学及组织表达分析
- 2023年
- 【目的】克隆赤水乌骨鸡成对样同源结构域转录因子1(paired-like homeodomain transcription factor 1,PITX1)基因并进行生物信息学分析,检测PITX 1基因在赤水乌骨鸡不同组织中的表达水平,为探究PITX 1基因在鸡肌肉生长发育中的生物学功能提供材料。【方法】以赤水乌骨鸡胸肌组织cDNA为模板,克隆PITX 1基因CDS区序列并测序,利用在线软件对所获序列进行比对及生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测PITX 1基因在赤水乌骨鸡心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺脏、胸肌和腿肌组织中的表达量。【结果】赤水乌骨鸡PITX 1基因CDS区长909 bp,存在5处同义突变,编码302个氨基酸。赤水乌骨鸡PITX 1基因氨基酸序列与原鸡、绿头鸭、日本鹌鹑、兔、小鼠的相似性分别为100%、99.7%、99.0%、85.0%和84.4%,与人、牛和野猪的相似性均为85.7%。系统进化树分析表明,赤水乌骨鸡和原鸡的亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远。赤水乌骨鸡PITX1蛋白属于亲水性蛋白,无跨膜结构和信号肽,有47个潜在磷酸化位点、1个N-糖基化修饰位点和15个O-糖基化修饰位点,主要分布在细胞核中。PITX1蛋白二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角组成,三级结构预测结果与其一致。蛋白互作分析结果显示,PITX1蛋白可能与BARX1、NKX2-8、POU1F1、EGR1、NR5A1、CTNNB1、TBX5和TBX4蛋白存在相互作用。实时荧光定量PCR结果显示,PITX 1基因在赤水乌骨鸡各组织中均有表达,其中在肺脏中的表达量最高,其次是肝脏和腿肌,在胸肌中的表达量最低。【结论】赤水乌骨鸡PITX 1基因CDS区长909 bp,编码302个氨基酸,为亲水性蛋白,主要分布在细胞核中。PITX 1基因在赤水乌骨鸡各组织中均有表达,且在肺脏中表达量最高。试验结果为进一步研究鸡PITX 1基因功能提供参考。
- 吴芸欧正淼李秋玉陈粉粉闫吉美
- 关键词：生物信息学
- 贵州麻羊mtDNA Cytb基因遗传多样性分析被引量：2
- 2008年
- 对贵州麻羊13个个体线粒体DNA细胞色素b基因全序列进行直接测序比对。结果表明,山羊线粒体细胞色素b基因全长为1 140 bp,T、C、A和G碱基的平均含量分别为26.8%、28.2%、31.9%和13.1%,碱基组成的百分比中显示出G的相对缺乏,A+T含量(58.7%)比G+C(41.3%)含量高;总共发现6个变异位点,分别为174、576、594、721、852、1 068;观察到3种单倍型;构建了16个山羊个体的N-J树,显示贵州黔北麻羊存在2个母系起源。
- 黄勤华刘若余吴芸王兴群
- 关键词：山羊细胞色素B
