刘次全 作品数:90 被引量:318 H指数:9 供职机构: 中国科学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中国科学院知识创新工程 云南省应用基础研究基金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 文化科学 理学 更多>>
溴代胞嘧啶对三螺旋DNA稳定性的影响 1999年 研究了三螺旋DNA中胞嘧啶被5-溴胞嘧啶取代后的稳定性问题。通过建立CGC,CGBrC,BrCGC和BrCGBrC4种模型,并采用InsightⅡ软件包中的Discover程序进行计算模拟,发现用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA分子中的胞嘧啶后,整个分子的稳定性有所降低。同时,当用5-溴胞嘧啶取代三螺旋DNA不同链上的胞嘧啶时,被取代链的碱基堆积能显著增高,导致分子链内稳定性降低,但被取代链和相邻链间相互作用能有所降低,使得链间作用趋向稳定。 李清 白春礼 ImshikLee 杨林静 邓文礼 王琛 王乃新 刘次全关键词:三螺旋DNA DNA 稳定性 胞嘧啶 分子进化研究:Ⅰ.细胞色素C分子进化的模糊聚类分析法研究 被引量:5 1991年 本文在强调生物系统自身特点的基础上,针对分子进化本身所具有的模糊性,运用模糊聚类分析的原理和方法,就29种动物细胞色素c一级结构间的进化关系进行了研究,作出了相应的分子系统树并运用硬划分法对该树进行了修改。同时,与其它一些研究的结果进行了比较,讨论了在生物大分子一级结构间进行比较、分析的局限性和分子进化研究中的一些有待解决的问题。 黄京飞 刘次全 王莹关键词:分子进化 细胞色素C 翻译过程中mRNA的拓扑形态及其链构象分析 被引量:1 2002年 对mRNA发夹结构和单链结构的理论模型构建,以及基于对X射线晶体衍射和NMR实验数据的模拟研究显示,在翻译过程中,核糖体上mRNA解折叠后的单链拓扑形态,与mRNA本身的发夹结构密切相关,均呈现为不同程度的螺旋与卷曲相间的构象.通过包括翻译速度在内的调节作用,这种构象可能会影响到新生肽链的折叠. 柳树群 刘次全关键词:翻译过程 发夹结构 链构象 解折叠 七种不同抗冷性植物甘油-3-磷酸转酰酶m RNA二级结构研究 被引量:7 2002年 对南瓜、豌豆、黄瓜、拟南芥菜、红花、菠菜、黑子南瓜等 7种不同抗冷性植物甘油- 3-磷酸酰基转移酶的mRNA序列作了三核苷酸碱基模式分析 ,并用Zuker方法对其mRNA序列的翻译区进行了二级结构分析 ,统计出发夹、内环、膨胀环、三分支环、四分支环等二级结构的基本结构单元数 ,通过对编码脯氨酸的密码子在mRNA二级结构中的分布位置的研究 ,发现这些密码子主要是分布在茎的末端、环的根部、膨胀环或分支环上 ,占到了序列中所有编码脯氨酸的密码子总数的 6 9%到 97%的比例 ,这与我们在研究其他物种的mRNA二级结构时的发现是一致的。 柳维波 曹槐 刘世熙 刘次全关键词:MRNA 脯氨酸 从氨基酸残基的静态可及性探讨组蛋白的分子进化 1997年 本文以蛋白质氨基酸残基的静态可及性为指标,分别探讨了H2A、H2B、H3、H4这4种组蛋白分子的进化关系,并获得了H2A、H2B和H3各自相应的分子系统树。该研究从分子进化的角度表明,在构成核小体的这4种组蛋白分子中,组蛋白H4的保守性最大。作者推测,与其他几种组蛋白相比,在维持染色体的结构、功能以及在染色体的起源上。 黄京飞 刘次全关键词:组蛋白 分子进化 氨基酸残基 三链DNA结构研究的新进展 1997年 本文详细总结了近年来三螺旋DNA的结构和应用研究方面的进展,分析了各种因素(例如pH、抗衡离子、温度等)对三螺旋稳定性的影响。 杨林静 刘次全 白春礼关键词:DNA 三链DNA 大肠杆菌mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性的关系 被引量:15 2006年 从GenBank获得大肠杆菌K-12MG1655株的全基因组序列,计算了与基因密码子偏好性相关的多个参数(Nc、CAI、GC、GC3s),对其mRNA编码区长度、形成二级结构倾向与密码子偏好性之间的关系进行了统计学分析,发现虽然翻译效率(包括翻译速度和翻译精度)是制约大肠杆菌高表达基因的密码子偏好性的主要因素,同时,mRNA编码区长度及其形成二级结构的倾向也是形成这种偏好性的不可忽略的原因,而且对偏好性有一定程度的削弱。另外对mRNA编码区形成二级结构倾向的生物学意义进行了讨论分析。 王侃 刘次全 曹槐 陈雪峰关键词:大肠杆菌 密码子偏好性 MRNA二级结构 DISTRIBUTIONS OF TRIPLET CODONS IN MESSENGER RNA SECONDARY STRUCTURES 被引量:1 1998年 Analysis of the secondary structures of mRNAs which encode mature peptides shows that the location of each codon in mRNA secondary structure has a trend, which appears to be in agreement with the conformational property of the corresponding amino acid to some extent. Most of the codons that encode hydrophobic amino acids are located in stable stem regions of mRNA secondary structures, and vice versa, most of the codons that encode hydrophilic amino acids are located in flexible loop regions. This result supports the recent conclusion that there may be the information transfer between the three dimensional structures of mRNA and the encoded protein. 张静 顾宝洪 彭守礼 彭守礼mRNA的序列、结构以及翻译速率与蛋白质结构的关系 被引量:17 1999年 mRNA所包含的核苷酸序列通过三联体密码子决定了蛋白质的氨基酸序列。但是, 由于对氨基酸同义密码使用频率上的差异, 密码子与反密码子相互作用效率上的不同, 以及密码子上下文关系和mRNA 不同区域二级结构上的差异, 造成了核糖体对mRNA 不同区域翻译速度上的差异, 加之共翻译折叠的作用, 使得mRNA 的序列和结构影响着蛋白质空间结构的形成。 柳树群 刘次全关键词:MRNA 蛋白质结构 三链DNA碱基配对的相互作用 被引量:1 1993年 本文按照经验的多原子分子间相互作用势研究了在三碱基体(triplet)中,两两碱基间的共平面相互作用。 我们以22个三碱基体的结构为理论模型,分别计算了Watson—Crick氢键碱基配对,Hoogsteen氢键碱基配对和其它形式(包括失配碱基对)的氢键碱基配对的总能量,通过对计算结果的分析,得到了与实验结果一致的结论,这一工作对于进一步从理论上探索多种形式的氢键相互作用的生物学意义将是有益的。 王莹 刘次全 荣茂森