张玮玮
- 作品数:4 被引量:12H指数:2
- 供职机构:山西生物应用职业技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金教育部科学技术研究重点项目辽宁省教育厅青年基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 基于生物信息学的冷休克结构域蛋白家族进化研究
- 本文基于公共数据库数据,以冷休克结构域蛋白超家族为例,利用生物信息学的理论和方法,对冷休克结构域蛋白超家族的分子进化进行深入研究,目的是揭示冷休克结构域蛋白超家族基因起源和进化的分子机制以及基因非编码区调控作用,并为深入...
- 张玮玮
- 关键词:生物信息学蛋白家族基因结构系统发育进化树
- 日本七鳃鳗(Lampetra japonica)Lyb基因的克隆与分析被引量:4
- 2008年
- 采用RT-PCR和RACE技术,从日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺、肝脏中分离获得了3条Y-box基因序列,分别命名为Lyb1、Lyb2和Lyb3,生物信息学分析其编码的蛋白质序列长度分别为331、181和171个氨基酸残基。采用DNAMAN软件,将七鳃鳗的3个Y-box蛋白氨基酸序列蛋蛋蛋、蛋马蛋、蛋蛋、蛋蛋蛋和小鼠Y-box蛋白进行同源性分析,结果显示他们共有一个保守的冷休克结构域,其中包含两个RNA结合基序RNP-1和RNP-2,表明获得的Lyb基因属于Y-box基因家族成员。此外,从Swiss-Prot下载了经实验验证过的Y-box蛋白序列数据,结合实验克隆得到的Lyb基因所编码的氨基酸序列构建系统发育树,发现Y-box基因在有颌类出现以前只有一种类型,有颌类出现以后,Y-box基因分化成YB1、YB2和CSDA三种类型。
- 金萍张玮玮黄惠芳马飞
- 关键词:系统发育分析
- Y-box结合蛋白功能及对肿瘤发生的影响被引量:7
- 2006年
- Y-box结合蛋白家族成员是一类高度保守的顺式作用元件,广泛存在于原核及真核生物细胞中。它是一种多功能蛋白,与转录调节、翻译调控、mRNA选择性剪接、DNA的修复、细胞增殖和再生等有关。Y-box结合蛋白的氨基酸序列包含3个结构域:氨基酸N末端,亲水结构域C末端,冷休克结构域(coldshockdomainCSD),保守的冷休克结构域决定了Y-box结合蛋白的大部分功能。最近研究发现,定位于细胞核中的YB-1蛋白在局部晚期非小细胞肺癌的预防上可作为新的靶位点,YB-1蛋白还可通过对抑癌基因p53启动子抑制起负调控作用,此外,YB-1蛋白在PI3K/Akt信号通路中也起到重要的作用,这些研究都为肿瘤的治疗提供了新的线索和启示。文章就Y-box结合蛋白功能及其对肿瘤发生的影响等方面进行概述。
- 张玮玮黄惠芳李庆伟马飞
- 关键词:转录调节翻译调控肿瘤发生
- 噬菌体及其宿主终端酶序列的系统进化研究被引量:1
- 2009年
- 在原核生物的进化过程中,基因的横向转移(HGT)是一个重要的进化机制。为了研究HGT在噬菌体及其宿主体内的发生情况,分析多个物种的终端酶蛋白质序列。结果显示,大部分噬菌体与其宿主间的蛋白质序列中,终端酶的大、小亚基的同源性都非常之高,小亚基的序列几乎与其宿主完全一致。相比之下,噬菌体间的蛋白质序列同源性非常低。系统发生分析显示,序列相似性高的噬菌体较容易与其宿主聚集,产生寄生关系。结果表明,在噬菌体及其选择的宿主之间存在HGT,而且这种作用可能对终端酶的进化产生重要的影响。
- 沙诗宇张玮玮马飞
- 关键词:细菌噬菌体分子进化