黎瑞源 作品数:26 被引量:98 H指数:7 供职机构: 贵州师范大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 贵州省科技厅科学技术基金 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 文化科学 自动化与计算机技术 更多>>
苦荞重组自交系群体F_5代SSR遗传图谱的构建 被引量:6 2017年 以"小米荞×晋荞2号"杂交组合,通过单粒传获得的245个F_5代重组自交系(命名为SJ-RILs)群体为作图材料,构建SSR遗传连锁图谱。结果显示:350对SSR引物在亲本间有多态性的为59对,多态率为16.9%;多态性引物在SJ-RILs群体共扩增出80个等位变异位点;来自小米荞和晋荞2号等位基因分别占群体总基因型的51.5%和48.5%;采用作图Jionmap4.0软件构建的遗传连锁图总长度为1 106.74cm,含11个连锁群,80个分子标记,其中偏分离标记27个,相邻标记的平均间距为13.83cm。结论:该图谱可为苦荞遗传图谱构建、重要性状QTL的定位和基因组学研究隆奠定基础。 黎瑞源 梁龙兵 石桃雄 霍冬敖 陈庆富关键词:苦荞 重组自交系 SSR标记 《服务器管理》教学方法探讨 被引量:1 2017年 《服务器管理》是英国高等教育文凭(HND:Higher National Diploma)计算机网络专业的核心专业课程,是学生职业技能实现的基础之一。针对目前课程教材和配套资料不明晰、上机实验环境不理想和采用的教学方法模式不适合的现状,提出了相应的改进方法,以期能有效改善教学效果、激发学生的学习兴趣、提升学生的动手能力和解决实际问题的能力。 黎瑞源关键词:服务器管理 教学方法 虚拟机 基于参考序列的生物DNA测序数据压缩技术研究 被引量:1 2020年 随着生物测序技术的不断发展,大量DNA短读片段产生。在相关计算机专家、生物学家对该领域研究的过程中,这些数.据的管理与分析处于重要地位。文章分析了基于高通量测序技术下的两种测序数据的压缩方法。最后得出结论:基于参考序列的压缩方法压缩比较高。 彭棋 申铁 黎瑞源关键词:测序技术 数据压缩 苦荞RILs群体千粒质量和粒形的遗传特性分析 2025年 【目的】千粒质量是苦荞产量性状三大构成因素之一,其大小由粒形(粒长、粒宽和粒厚)和籽粒充实度等决定,研究千粒质量和粒形的遗传变异与分子机理对苦荞育种有着十分重要的意义。【方法】以‘晋荞麦2号×品苦1号’衍生的重组自交系(JP-RILs)群体为材料,在2个环境中对粒长、粒宽、长宽比及千粒质量等4个性状进行变异、主基因+多基因遗传模型、相关性和聚类等分析。【结果】在E1和E22个环境中,JP-RILs群体的4个调查性状均呈现连续的变异及明显的双向超亲分离现象,其中长宽比变异系数最大(15.30%、15.70%),其次是粒长(11.27%、11.03%),粒宽变异系数最小(5.46%、5.94%)。粒宽的最佳模型均为MX1-A-AI,受1对加性上位性主基因+加性多基因控制,主基因遗传率分别为69.84%和62.68%,多基因遗传率分别为23.90%和34.24%。长宽比的最佳模型均为4MG-AI,受4对加性主基因控制,主基因遗传率分别为98.07%和98.26%。粒长的最佳模型分别为4MG-AI和1MG-A,受4对或1对加性主基因控制,主基因遗传率分别为97.98%和88.39%。千粒质量的最佳模型分别为2MG-DE和4MG-EEEA,受2对重叠主基因或4对加性主基因控制,主基因遗传率分别为36.61%和70.43%。聚类分析筛选出千粒质量较大的长粒和圆粒类型以及千粒质量较低的圆粒类型,可作为新品种选育以及粒形和千粒质量遗传学研究的基础材料。【结论】苦荞JP-RILs群体千粒质量和粒形均存在明显的主效基因,且上位性效应占主导地位,为苦荞粒形和千粒质量的QTL定位和遗传改良提供依据。 石茂竹 黎瑞源 刘迪 陈庆富 王莉花 石桃雄关键词:苦荞 重组自交系 粒形 主基因+多基因遗传模型 聚类分析 苦荞重组自交系群体粒重、粒形与蛋白组分含量的变异 被引量:6 2021年 通过研究苦荞粒重、粒形与蛋白组分含量的遗传变异和相关性,探索影响苦荞蛋白组分含量的主要性状,筛选综合性状优良的株系。以小米荞×晋荞麦2号衍生的重组自交系(XJ-RILs)群体为试验材料,对粒重、粒形相关性状和籽粒蛋白组分含量和总蛋白含量进行变异分析、相关性分析和聚类分析。结果表明:除醇溶蛋白含量外,父本晋荞麦2号的千粒重、粒长、粒宽、长宽比、清蛋白、球蛋白、谷蛋白和总蛋白含量均显著(P<0.05)高于母本小米荞;在XJ-RILs群体中,各性状变异系数为5.79%~29.97%,且存在双向超亲分离现象;千粒重与粒长、粒宽、球蛋白、谷蛋白和总蛋白含量呈极显著(P<0.01)正相关,粒长与谷蛋白含量呈极显著正相关,粒宽与球蛋白和总蛋白含量呈极显著(P<0.01)正相关;基于各性状的表型值,在欧式距离为12.10~13.50处,将220个株系划分为12个类群,其中C9类群粒长、长宽比、清蛋白和总蛋白含量较高,C10类群千粒重、球蛋白、谷蛋白和总蛋白含量较高,C11类群千粒重、粒长、长宽比、球蛋白和醇溶蛋白含量较高。该结果为进一步研究籽粒各蛋白组分含量的基因型差异提供了重要的试验材料,筛选获得的蛋白组分优异株系为不同食品和保健品的加工提供了推荐材料。 郑俊青 黎瑞源 郑冉 吕丹 陈其皎 石桃雄 陈庆富关键词:苦荞 重组自交系 粒形 蛋白组分 一种改进的4参数等级反应模型和应用 2023年 针对在实际测验中各等级的猜测参数、失误参数可能存在不一致性问题,该文提出等级反应模型的改进模型.以2等级项目为例,通过模拟数据检验模型发现:使用4参数GRM模型估计参数的误差随着猜测参数和失误参数的各个不一致性而增大,而改进后的模型具备更好的稳定性.在实际的地理测验中,发现等级反应项目中的猜测度较低,但失误现象明显,并且参数之间的差异性较大,不可以忽略. 曾光 张玉玲 谢晓尧 黎瑞源关键词:项目反应理论 等级反应模型 荞麦分子遗传学研究进展 被引量:8 2014年 近年来生物技术使荞麦的分子遗传学研究取得了长足的进步,为进一步对荞麦分子遗传学进行研究,从种间亲缘关系、种质资源遗传多性性、遗传图谱构建、农艺性状及相关基因定位、基因克隆及功能研究、基因组测序等6个方面对荞麦分子遗传学研究进展进行了综述,提出了荞麦分子遗传研究中存在的问题,并对其发展趋势进行了展望。 黎瑞源 石桃雄 刘筱嘉 陈庆富关键词:荞麦 分子标记 基因克隆 四球茶转录组SSR位点信息分析 被引量:8 2017年 对基于高通量测序拼接获得的99 741条四球茶嫩叶Unigenes进行了SSR(simple sequence repeats)位点分析,共揭示了23 732个SSR位点,分布于18 552条Unigenes中,SSR发生频率为23.79%;含有SSR位点的Unigenes的总长度为226 188 bp,SSR位点间的平均距离为1/2.07 kb,重复长度平均长度为9.53 bp。在四球茶转录组SSR中,二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占总SSRs的47.53%和25.92%;在181种重复基元类型中,优势重复基元分别是AG/CT、A/T、ACC/GGT,分别占总SSRs的41.38%、22.10%和6.49%,共占总SSRs的比例达69.97%。 黎瑞源 邢辉 申铁关键词:转录组 SSR 基于主成分分析的苦荞麦重组自交系农艺性状综合评价 被引量:2 2024年 为筛选出综合性状优良的种质,为苦荞麦高产品种的选育推荐材料,对选取的58个具有高产潜质的重组自交系(RILs)及其双亲的10个主要农艺性状进行遗传变异分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析。结果表明,58个RILs各性状的变异系数介于5.71%~31.55%,其中,产量、生育期和主茎分枝数的变异系数较大,粒宽和籽粒周长的变异系数较小。产量与籽粒面积、籽粒周长、株高和千粒重呈极显著(P<0.01)正相关,与粒长和粒宽呈显著(P<0.05)正相关,与生育期呈极显著负相关,产量与上述指标的相关系数绝对值从大到小依次为千粒重>株高>籽粒面积>生育期>籽粒周长>粒宽>粒长。主成分分析结果表明,前4个主成分的累计贡献率达86.987%,分别是粒形与产量因子(39.940%)、粒宽因子(24.478%)、株高因子(11.667%)、主茎分枝数与生育期因子(10.893%)。基于综合评价结果及RILs与亲本间的方差分析,共筛选出R64、R103、R164、R84、R192、R153和R214等7个综合性状优良的非米荞型RILs。这7个株系在聚类分析中均被划分在了高产、大粒、高秆和生育期短的C2类群,可将其作为示范推广品种或西南地区常规苦荞育种的优良种质资源加以利用。米荞型株系R52、R198和R101的产量极显著或显著高于米荞型亲本小米荞,可用于苦荞麦高产薄壳品种的选育。 薛贤滨 贾琼 陈峥峰 黎瑞源 陈庆富 石桃雄关键词:苦荞麦 重组自交系 农艺性状 主成分分析 聚类分析 苦荞(Fagopyrum tataricum)RILs群体果壳率相关性状的变异分析和QTL定位 2024年 为选育薄果壳大粒的苦荞(Fagopyrum tataricum)品种和挖掘果壳率相关性状候选基因,本研究以‘小米荞’(米荞型)和‘晋荞麦2号’(非米荞型)为亲本构建的重组自交系(recombinant inbred lines,RILs)群体为供试材料,分析了两个生长季节苦荞RILs群体的果壳率、百粒重、百粒果仁重和百粒果壳重等4个性状的遗传变异和数量性状座位(quantitative trait locus,QTL)。结果显示,非米荞型亲本和非米荞型株系的4个果壳率相关性状均值均高于米荞型亲本和米荞型株系的。米荞型和非米荞型株系的4个果壳率相关性状变异系数分别在9.01%~15.66%和8.21%~14.04%。果壳率与百粒重、百粒果仁重和百粒果壳重均呈极显著正相关。通过聚类分析筛选到米荞型株系R160、R198、R199和R46,以及非米荞型株系R102、R120、R125、R142、R157和R178在两个生长季节均表现低果壳率和高百粒重的特点,可作为薄壳大粒苦荞品种选育的候选材料。两个生长季节共检测出17个QTL,其中百粒重、百粒果仁重、百粒果壳重和果壳率的QTL数目分别为5个、4个、5个和3个,单个QTL的表型贡献率为3.76%~48.65%。QTL簇qC1.2含果壳率、百粒重、百粒果仁重和百粒果壳重稳定主效QTL各1个,与已经报道的控制果壳类型和粒重的主效QTL重叠。研究结果可为苦荞果壳率相关性状的分子改良、基因的精细定位和克隆提供理论依据。 薛贤滨 黎瑞源 任蓉蓉 贾琼 陈峥峰 陈庆富 王莉花 石桃雄关键词:苦荞 QTL定位 候选基因